Ключовата разлика между пепсин и ренин е, че пепсинът, който е един от основните храносмилателни ензими, е протеаза, секретирана от стомаха, докато ренинът е ензим, а също и хормон, произведен от юкстагломерулни клетки на бъбреците.
Протеазите са ензими, които хидролизират пептидните връзки и разграждат протеините до пептиди или аминокиселини. Пепсинът е протеаза, присъстваща в стомашния сок. Това е един от основните храносмилателни ензими, които разбиват белтъчните храни на пептиди и аминокиселини. За разлика от тях, ренинът е ензим и аспарагинова протеаза. Това е инициативният ензим на системата ренин-ангиотензин. Ренинът работи като хормон и помага да се контролира кръвното налягане.