Ключовата разлика между плурипотентните и индуцираните плурипотентни стволови клетки е, че плурипотентните клетки са недиференцирани майчини клетки (от ембриони и др.), Които имат естествената способност да се диференцират в различни клетъчни типове, докато индуцираните плюрипотентни стволови клетки са соматични възрастни клетки, които имат са генетично препрограмирани, за да показват характеристики, подобни на естествените плюрипотентни стволови клетки.
Стволовата клетка е недиференцирана клетка, която има уникалната способност да се развива в различни или специализирани клетки. Освен това стволовите клетки са от три вида, а именно унипотентни, плюрипотентни и мултипотентни. Ако стволовата клетка може да се диференцира в един, множество и във всички видове клетки, тя е известна като унипотентна, мултипотентна или плурипотентна стволова клетка, съответно. Сред горните три типа плюрипотентните стволови клетки са важни, тъй като те могат да се диференцират във всички клетъчни типове. Плурипотентната ембрионална стволова клетка може да се развие в цяло човешко същество.