Ключовата разлика между алела и локуса е, че алелът се отнася до една от двете или повече алтернативни последователности на ген в определен локус, докато локусът се отнася до определено място в хромозомата, където може да бъде намерен ген.
Под формата на гени генетичната информация наследява от родителите на потомството. Гените са специфичните нуклеотидни последователности, разположени в хромозомите. Много гени могат да бъдат намерени в генома на организма. Разположението им в генома е точно и местоположението на гена може лесно да бъде намерено с помощта на генетичен маркер. Освен това, определен ген може да има различни версии, които ние наричаме алели. Конкретното местоположение на ген в хромозомата също е много важно и ние го наричаме локус.
