Ключовата разлика между плюрипотентните и мултипотентните стволови клетки е, че плюрипотентните клетки имат способността да се диференцират във всеки клетъчен тип от трите зародишни слоя, докато мултипотентните стволови клетки имат способността да се развиват в ограничен диапазон от специфични клетъчни типове.
Определени клетки имат способността да се диференцират в други видове специализирани клетки. Тази способност се нарича клетъчна потентност. Когато клетката е в състояние да се диференцира в повече видове клетки, тази конкретна клетка има голяма сила. По същия начин стволовите клетки имат голяма клетъчна сила. Те са недиференцирани клетки на многоклетъчни организми, които могат да се делят бързо и да се диференцират в други клетъчни типове. Съответно има два основни типа стволови клетки. А именно, те са ембрионални стволови клетки и възрастни стволови клетки. Въз основа на способността да се диференцират в клетъчни типове, някои стволови клетки са тотипотентни, докато някои са плюрипотентни и мултипотентни. Плурипотентните стволови клетки могат да станат всякакъв тип клетки в трите зародишни слоя, докато мултипотентните стволови клетки могат да се диференцират в специфични клетъчни типове. Съответно ембрионалните стволови клетки са плюрипотентни клетки. От друга страна, кръвните стволови клетки са мултипотентни стволови клетки.
