Ключовата разлика между пъпките и образуването на спори е, че пъпките са вид безполово размножаване, при което нов организъм произхожда от малка пъпкоподобна структура, развита върху родителския организъм, докато спорообразуването е форма на безполово размножаване, при което нови индивиди произхождат директно от спорите на родителя.
Пъпките и образуването на спори са два различни метода на безполово размножаване. И двете, образуването на пъпки и образуването на спори включват самотен родител. Следователно няма смесване или обмен на генетичен материал. Ето защо потомството, получено чрез пъпки и образуване на спори, е генетично идентично с техния родителски организъм.
