Ключовата разлика между оомицетите и зигомицетите е, че оомицетите не съдържат хитин в клетъчните си стени, вместо това съдържат целулоза, бета глюкани и аминокиселина хидроксипролин, докато зигомицетите съдържат хитозан върху клетъчните си стени. Друга разлика между оомицетите и зигомицетите е, че вегетативното състояние на оомицетите е диплоидно, докато зигомицетите са хаплоидни или дикариотични.
Оомицетите и зигомицетите са микроскопични еукариотни организми. Оомицетите наподобяват истински гъби. Но те са плесени за вода. Зигомицетите са един основен клас от тип Zygomycota, които са истински гъби. Те са повсеместни, сапрофитни, гъби в околната среда.