Ключовата разлика между йерархичното и цялото геномно секвениране на пушки е, че при йерархичното секвениране на пушка геномът се разбива на по-големи фрагменти преди секвенирането, докато при секвенирането на цели геномни пушки целият геном се разбива на малки фрагменти за секвениране.
Последователността е важна техника в молекулярните процеси, особено при точното идентифициране на видовете. Всъщност това е техниката за идентифициране на точния ред на нуклеотиди в ген или геном. Има много техники за секвениране. Някои от тях включват метод на Maxam Gilbert, метод на Sanger и автоматизиран метод на Sanger.