Основната разлика между спората и вегетативната клетка е, че спората е неактивна, спяща структура, която е устойчива на тежки условия на околната среда, докато вегетативната клетка е активна нормално растяща клетка, която не може да устои на суровите условия на околната среда.
Вегетативните клетки са нормалните живи клетки, които са метаболитно активни. Вегетативните клетки произвеждат малки структури, наречени спори, когато условията на околната среда не са добри за оцеляване на вегетативните клетки.