Ключовата разлика между ацетил КоА и ацил КоА е, че ацетил КоА (или ацетил коензим А) помага в протеиновия, въглехидратния и липидния метаболизъм, докато ацил КоА (или ацил коензим А) помага в метаболизма на мастните киселини.
Acetyl CoA е много полезен при доставянето на ацетиловата група в цикъла на Krebs за производство на енергия. Ацетилова група е функционална група, която има химическата формула -С (О) СН 3. Ацилната група е също функционална група с химическа формула -C (O) R, където R групата е странична верига на мастна киселина. Полезен е при производството на енергия чрез превръщане в ацетил КоА.
