Ключовата разлика между изо и нео структурите е, че префиксът изо се отнася до органично съединение, съдържащо всички въглеродни атоми с изключение на един, образуващ непрекъсната верига, докато префиксът нео се отнася до органично съединение, съдържащо всички въглеродни атоми с изключение на два, образуващи непрекъсната верига.
Използваме префикси в органичната химия, за да разграничим една органична молекула от друга. Използваме тези префикси заедно с името на съединението. Тъй като тези префикси са специфични за различни функционални групи в органичните молекули, можем лесно да идентифицираме органичните молекули, дори те да имат тясно свързани химични структури.