Основната разлика между калциевия хипохлорит и натриевия хипохлорит е, че калциевият хипохлорит съдържа два хипохлоритни аниона, свързани с един калциев катион, докато натриевият хипохлорит съдържа един хипохлоритен анион, свързан с един натриев катион. На външен вид калциевият хипохлорит е бял до сив прах, докато натриевият хипохлорит е зеленикаво-жълто твърдо вещество със сладка миризма.
Калциевият и натриевият хипохлорит са йонни съединения, съдържащи метален катион и хлорен производен анион. Броят на анионите на катион на тези съединения се различава един от друг в зависимост от валентността на металния катион.
