Ключовата разлика между асимилаторната и дисимилаторната сулфатна редукция е, че асимилиращата сулфатна редукция произвежда цистеин като краен продукт, докато дисимилиращата сулфатна редукция произвежда сулфид като краен продукт.
Редукцията на сулфат е един от основните анаеробни дихателни пътища. Освен това, някои микроби, които зависят от анаеробните условия, са способни да редуцират сулфатите, за да получат енергия. Освен това има два основни пътя, при които сулфатите намаляват; те са асимилаторният път и дисимилаторният път. При което по асимилаторния път намаляването на сулфата води до получаване на цистеин като краен продукт, който може да бъде асимилиран в живи организми като растения и висши еукариоти. Напротив, дисимилаторният път на редукция на сулфат дава сулфид като краен продукт. Следователно, най-съществената, различима разлика между асимилаторната и дисимилаторната редукция на сулфата е видът на крайния продукт, който всеки продукт произвежда.
