Ключовата разлика между нефридиите и малпигиевите тубули зависи от появата им в организмите. Нефридии присъстват в по-ниски организми като червеи и мекотели, докато малпигиевите тубули присъстват в задните части на насекомите и сухоземните членестоноги.
Екскрецията е важен аспект на живите организми. Метаболитните пътища генерират различни отделителни продукти като странични продукти. Въпреки това натрупването на отпадъци в живата телесна система е токсично и вредно. Следователно, наличието на механизъм за отстраняване на метаболитни отпадъци от организма чрез система за отделяне е задължително. Следователно, различни видове отделителни органи присъстват в различни групи организми. Нефридия и малпигиевите тубули са два примера за такива отделителни органи.