Ключовата разлика между микоплазмата и хламидията е, че микоплазмата е род бактерии, на които липсва клетъчна стена, докато хламидията е род бактерии, който включва грам-отрицателни и облигатни паразити.
Видовете микоплазма са най-малките бактерии, които са открити досега, с най-малки геноми и минимален брой изключително важни органели. Микоплазмата е безстенна бактерия. Следователно те нямат определена форма. Обикновено те са сферични спрямо нишковидни клетки. За разлика от тях, хламидията е род бактерии, които имат клетъчни стени. Те са грам-отрицателни бактерии. И микоплазмата, и хламидията причиняват болести, предавани по полов път. Освен това те произвеждат подобни симптоми, но могат да бъдат лекувани с различни антибиотици.
