Ключовата разлика между гъбичките и паразитите е, че гъбите са група еукариотни сапротрофни организми, включително дрожди, плесени и гъби, докато паразитите са група организми, които живеят в или вътре в друг организъм, получавайки хранителни вещества.
Както гъбичките, така и паразитите причиняват различни заболявания при хората. Не само при хората, но паразитите причиняват заболявания и при други животни и растения. Паразитите са организмите, които показват начин на живот, наречен паразитизъм. Паразитизмът е един от трите вида симбиотични взаимоотношения, които съществуват между два или повече вида, живеещи заедно. Някои видове гъби, някои насекоми, протозои и хелминти са примери за паразити. При паразитирането паразитите живеят във или вътре в друг организъм, наречен гостоприемник; паразитизмът дава предимства само на паразита, като същевременно причинява заболявания на неговия приемник. Освен това паразитите не могат да оцелеят без своите домакини.