Ключовата разлика между хемоорганотрофите и хемолитотрофите е, че хемоорганотрофите са организми, които получават електрони от органични съединения, докато хемолитотрофите са организми, които получават електрони от неорганични съединения.
Живите организми могат да бъдат групирани в няколко категории по отношение на хранителния режим въз основа на източника на енергия и въглерод. Има източници на енергия като слънчева светлина и органични съединения. По същия начин има два вида източници на въглерод като неорганичен въглерод и органичен въглерод. Четирите основни категории са фотоавтотрофи, фотохетеротрофи, хемоавтотрофи и хемохетеротрофи. Освен това, въз основа на първоизточника на редуциращ еквивалент, има две категории като органотрофи и литотрофи. Хемоорганотрофите и хемолитотрофите са две групи, които използват енергия от разграждането на химични съединения. Но те се различават помежду си въз основа на донора на електрони. Източникът на електронен донор е органични съединения в хемоорганотрофите, докато източникът на редуциращ еквивалент е неорганичен в хемолитотрофите.