Ключовата разлика между фаголизозома и фагозома е, че фаголизозомата е цитоплазматично тяло, образувано от сливането на фагозома с лизозома. Междувременно фагозомата е везикул, образуван около частиците, погълнати от фагоцитна клетка по време на фагоцитоза.
Фагоцитозата е защитен механизъм, използван в определени клетки или организми за отстраняване на чужди частици от тялото. Фагоцитите са клетките, които извършват фагоцитоза. Фагоцитите са видове бели кръвни клетки, особено неутрофили, моноцити и макрофаги, присъстващи в кръвта. Тези клетки предпазват тялото, като откриват чужди частици като бактерии, токсини, мъртви и умиращи соматични клетки и др. Фагоцитите след това ги поглъщат и унищожават. Фагоцитозата е вид ендоцитоза. Чрез фагоцитоза твърдите частици се интернализират в структура, наречена фагозома. След като са попаднали във фагозомата, те се сливат с лизозоми и образуват фаголизозоми. След това с помощта на лизозомните хидролазни ензими частиците във фагозомата се разграждат и унищожават.
