Ключовата разлика между мутаген и тератоген е, че мутагенът е вещество или агент, който причинява промяна в последователността на ДНК на индивида, докато тератогенът е агент, който причинява вреда на плода или развиващия се ембрион по време на бременност.
Мутагените и тератогените обикновено са химически агенти. Физическите и биологичните агенти обаче могат да действат и като мутаген или тератоген. И двете могат да доведат до много вредни или смъртоносни ефекти върху хората. Подобряването на биотехнологиите обаче даде нови идеи както за концепциите за мутагени, така и за тератогени.
