Ключовата разлика между тавтомерия и метамеризъм е, че тавтомерията се отнася до динамичното равновесие между две съединения с една и съща молекулна формула, докато метамеризмът се отнася до структурна изомерия, при която различни алкилови групи са свързани към една и съща функционална група.
Изомеризмът е съществуването на химични съединения със същата структурна формула, но различни пространствени разположения. Следователно изомерите имат еднакъв брой атоми във всеки елемент, но тяхното разположение е различно. Изомерите могат да бъдат категоризирани главно в две групи като структурни изомери и стереоизомери. Тавтомеризмът и метамеризмът са два подразделения на структурната изомерия.