Ключова разлика - метаболомика срещу метабономика
Метаболитите са малките молекули, участващи в метаболитните реакции в клетките. Метаболитите включват метаболитни междинни продукти, хормони, вторични метаболити, сигнални молекули и др. Те са функциониращите молекули на биохимичните реакции на клетките. Пълният набор от метаболити на биологична проба или на отделен организъм е известен като метаболом. Метаболомът е динамична колекция, която се променя всяка секунда в тялото. Метаболомиката и метабономиката са два термина, свързани с изучаването на метаболома на организма. Основната разлика между метаболомиката и метабономиката е, че метаболомиката е по-загрижена за нормалния ендогенен метаболизъм и метаболитно профилиране на клетъчно или органно ниво, докато метабономиката е по-ангажирана с разширяване на метаболитното профилиране с информация за нарушения на метаболизма поради фактори на околната среда, заболявания, червата микроорганизми и сравняване на метаболитно профилиране и т.н.
СЪДЪРЖАНИЕ
1. Общ преглед и ключова разлика
2. Какво е метаболомика
3. Какво е метабономика
4. Сравнение рамо до рамо - метаболомика срещу метабономика
5. Резюме
Какво е метаболомика?
Метаболомиката е изследване на метаболитните процеси, които се случват в клетки, биофлуиди, тъкани или организми. Включва идентификацията и количественото определяне на клетъчните метаболити с помощта на добри аналитични и статистически инструменти. Метаболомиката се счита за важно проучване, тъй като разкрива информация за метаболизма на организма.
За да изследва субстрати и продукти от метаболитни реакции, метаболомиката използва масова спектрометрия като аналитична платформа. Мас спектрометрията разкрива видове метаболити и техните концентрации, отразяващи действителното биохимично състояние на клетките или тъканите. Следователно метаболомиката може да се счита за най-добрия представител на молекулярния фенотип на организма. Метаболомиката е омична технология на малки молекули на организмите и в сравнение с други омични изследвания; метаболомиката е много важна, тъй като тя пряко отразява текущото състояние на биохимичната реакция на клетките.
Метаболомиката може също да се разглежда като продължение на протеомиката, тъй като се генерира поради дейностите на ензими, които са протеини, както е показано на следващата фигура.
Фигура 01: Схема на метаболомика
Какво е метабономика?
Метабономиката се дефинира като количествено измерване на мултипараметричните метаболитни отговори в определени моменти във връзка с патофизиологичните стресове или генетичната модификация. Това обикновено се прилага за проучвания, проведени за човешкото хранене и отговори на лекарства или заболявания. Този подход е пионер на Джеръми Никълсън от Imperial College, Лондон и той е използван в редица области, включително токсикология, диагностика на болести, хранене и др. В исторически план метабономиката е един от първите методи за прилагане на обхвата на системната биология към изследвания на метаболизма.
Метабономиката е по-загрижена за сравняването на биохимичните профили, отколкото за идентифицирането на отделни метаболитни съединения в метаболомиката. Следователно метабономиката може да се определи като подмножество на метаболомиката. Той набляга главно на сравнението на метаболитните профили на различни популации по отношение на болести, стрес в околната среда, генетична модификация, хранене, лекарства и т.н., тъй като метаболитите са добрите маркери, които сигнализират за болестните състояния, ефектите на лекарствата, стресовете в околната среда, излагането на токсини и т.н.
Метабономните проучвания разкриват както вътреклетъчни, така и извънклетъчни метаболити. Той използва техники с висока производителност, за да анализира огромен брой метаболити едновременно и многократно, позволявайки времево изследване на физиологичния статус на клетките. Той също така разкрива връзката между метаболитите и патологичния статус на организма. В подкрепа на метабономичните изследвания могат да се използват геномика и протеомика, тъй като те са взаимосвързани, както е показано на горната фигура.
Каква е разликата между метаболомика и метабономика?
Различна статия Средна преди таблица
Метаболомика срещу метабономика |
|
| Метаболомиката е изследване на пълния набор от метаболити на организма | Метабономиката е количествено изследване на мултипараметричните метаболитни отговори на живите системи във времева основа на патофизиологични стимули или генетична модификация. |
| Основно притеснение | |
| Метаболомиката се занимава повече с метаболитно профилиране и идентифициране на отделни метаболити, присъстващи в клетките. | Метабономиката се занимава повече със сравняването на метаболитите или метаболитните профили на популациите във връзка с генетични модификации, заболявания, стрес на околната среда, патологични стимули, лекарства и др. |
| Информация | |
| Метаболомиката е фокусирана основно върху ендогенния метаболизъм. | Метабономиката не се ограничава до ендогенния метаболизъм. Той се разпростира, за да намери информация за смущения в метаболизма, причинени от вътрешни и външни фактори като хранителен режим, токсини, болестни процеси и др. |
| Аналитични инструменти | |
| Той използва масовата спектрометрия като основна аналитична платформа | Metabonomics използва ЯМР спектроскопия като основна аналитична платформа. |
Резюме - Метаболомика срещу метабономика
Метаболомът представлява пълния набор от малки молекули, наречени метаболити, налични в клетка или в организъм. Метаболомиката е изследване на целия метаболом за генериране на метаболитния профил. Метаболомиката позволява на учените да измерват действителното физиологично състояние на клетката или организма. Метабономиката е част от метаболомиката, която се простира до извличане на информация за многопараметричните метаболитни отговори на живите системи на патофизиологични стимули и генетични модификации. Метабономиката не се занимава само с индивидуално метаболитно профилиране като метаболомиката; той сравнява метаболитните профили във връзка с други фактори като стрес на околната среда, болести, токсини и др. И метаболомиката, и метабономиката включват изследвания на метаболити на организмите за измерване на действителното физиологично състояние на клетките. Следователно,понякога тези двама се считат за синоними, без да се отчита разликата между метаболомиката и метабономиката.
