Ключова разлика - VNTR срещу STR
ДНК изследванията имат огромна полезност при разбирането и определянето на филогенетични взаимоотношения, диагностицирането на генетични заболявания и картографирането на геномите на организма. Няколко техники, свързани с ДНК анализ се използват за идентифициране на определен ген или ДНК последователност в група от неизвестни ДНК. Те са известни като генетични маркери. Генетичните маркери се използват в молекулярната биология за идентифициране на генетични вариации между индивидите и видовете. Тандемното повторение с променлив брой (VNTR) и краткото тандемно повторение (STR) са два вида генетични маркери, които показват полиморфизъм сред индивидите. И двата типа са некодиращи се повтарящи се ДНК, които са тандем повторения. Те са подредени по хронозомен начин от главата до опашката. VNTR е част от генома, където късата нуклеотидна последователност се повтаря няколко пъти. STR е друга част от ДНК в генома, която е организирана като повтарящи се единици, състоящи се от два до тринадесет нуклеотида на сто пъти. Ключовата разлика между VNTR и STR е броят на нуклеотидите в повтаряща се последователност. Повтарящите се единици на VNTR се състоят от 10 до 100 нуклеотида, докато повтарящата се единица на STR се състои от 2 до 13 нуклеотида. VNTR и STR се използват широко в криминалистичните изследвания.
СЪДЪРЖАНИЕ
1. Общ преглед и ключова разлика
2. Какво е VNTR
3. Какво е STR
4. Сходства между VNTR и STR
5. Сравнение едно до друго - VNTR срещу STR в таблична форма
6. Резюме
Какво е VNTR?
Тандемното повторение е кратка последователност от ДНК, която се повтаря в посока от глава до опашка при специфичен хромозомен локус. Няма друга последователност или нуклеотид в тандемното повторение. Има няколко вида тандемни повторения в генома. VNTR е вид тандем повторение сред тях, който има повтарящи се единици, състоящи се от 10 до 100 нуклеотида. VNTR е вид минисателит. Тези тандемни повторения могат да бъдат намерени в много хромозоми. Те са разпръснати в човешкия геном и са разположени предимно в субтеломерните области на хромозомите.
VNTR показват тандем повтарящ се полиморфизъм сред индивидите. Дължината на VNTR в определено местоположение на хромозомата е силно променлива сред индивидите поради вариацията в броя на повтарящите се единици, организирани в тази ДНК секция. Следователно VNTR може да се използва като мощен инструмент за идентифициране на индивиди и анализът на VNTR се използва в много области, включително генетика, биологични изследвания, криминалистика и ДНК пръстови отпечатъци. VNTR са първите генетични маркери, използвани за количествено определяне на присаждането на костен мозък. VNTR също са първите полиморфни маркери, използвани при профилиране на ДНК в криминалистиката.
Фигура 01: Вариация на VNTR при шест индивида
Анализът на VNTR се извършва чрез полиморфизъм на дължината на рестрикционен фрагмент, последван от южна хибридизация. Следователно се нуждае от сравнително голяма ДНК проба. Тълкуването на профила на VNTR също е проблематично. Поради тези ограничения, използването на VNTR в съдебната генетика е ограничено и е заменено от STR анализ.
Какво е STR?
STR е силно повтаряща се секция на ДНК, която се състои от две до тринадесет нуклеотидни повтарящи се единици, организирани по тандемен начин. STR е подобен на VNTR. Но варира от VNTR от броя на нуклеотидите в повтаряща се последователност и броя на повторенията. STR е вид микросателит.
STR анализ, включен в измерването на точния брой повтарящи се единици. STRs са силно променливи сред индивидите, подобно на VNT. STR профилите се различават от човек на човек. Следователно, STR анализът се използва в молекулярната биология за сравняване на специфични локуси върху ДНК от две или повече проби. Следователно STRs се считат за мощни генетични маркери в молекулярната биология. Предоставя отличен инструмент за идентифициране на индивиди поради тяхната висока степен на полиморфизъм и относително малка дължина.
Понастоящем STR са най-често използваният инструмент за генетичен полиморфизъм в съдебната генетика. Повечето съдебни дела включват полиморфен анализ на STR. STR локусите са разпространени в целия геном. Има хиляди STR, разположени в хромозоми, които могат да бъдат използвани при съдебен анализ. STR анализът не включва полиморфизъм на ограничителната дължина като VNTR анализ. STR анализът не реже ДНК с рестрикционни ензими. Използват се специфични сонди за прикрепване на желани участъци върху ДНК и с помощта на PCR техника се определят дължините на STR.
Фигура 02: STR вариация между пробите
Какви са приликите между VNTR и STR?
- VNTR и STR са некодираща ДНК.
- И двете са тандем повторения.
- И двамата показват полиморфизъм сред индивидите поради разликата в дължината на ДНК секцията.
- И двете се използват като мощни генетични маркери в ДНК пръстовия отпечатък и в криминалистичните изследвания.
Каква е разликата между VNTR и STR?
Различна статия Средна преди таблица
VNTR срещу STR |
|
| VNTR е некодираща се повтаряща се ДНК, която има къса нуклеотидна последователност, повтаряща се в тандем. | STR е силно повтаряща се секция на ДНК, която се състои от две до тринадесет нуклеотидни повтарящи се единици, организирани по тандемен начин. |
| Размер | |
| VNTR са по-големи от STR. | STR са по-малки от VNTR. |
| Брой нуклеотиди в повтаряща се последователност | |
| Повтарящата се единица на VNTR се състои от 10 до 100 нуклеотида. | Повтарящата се единица на STR се състои от 2 до 13 нуклеотида. |
Резюме - VNTR срещу STR
VNTR и STR са два мощни генетични маркера, използвани в молекулярната биология, особено в областта на съдебната генетика. VNTR е вид минисателит, а STR е микросателит. VNTR и STR са некодираща, многократно повтаряща се ДНК. Те са тандем повторения. Общата структура на VNTR и STR са еднакви. Въпреки това броят на нуклеотидите в повтарящата се последователност и дължината са различни. VNTR има повтарящи се последователности, състоящи се от 10 до 100 нуклеотида. STR има повтарящи се последователности, състоящи се от 2 до 13 нуклеотида. Това е разликата между VNTR и STR.
Изтеглете PDF версия на VNTR срещу STR
Можете да изтеглите PDF версия на тази статия и да я използвате за офлайн цели според бележките към цитата. Моля, изтеглете PDF версия тук Разлика между VNTR и STR.
