Ключовата разлика между мезенхима и ектомензенхима зависи от вида на клетките, които те съдържат. Мезенхимът съдържа хлабави клетки, които лесно мигрират, за да образуват земната тъкан на колаген, и костната и хрущялната тъкан, докато ектомензенхимът съдържа клетки на нервния гребен и образува тъканите на шията и черепа.
Както мезенхимът, така и ектомезенхимът присъстват в ембрионалния стадий. Развитието на мезенхима и ектомензенхима е важно за изследване развитието на различни тъкани, които възникват от тези клетки.
