Ключовата разлика между нуклеотида и нуклеозида е, че нуклеотидът съдържа фосфатна група, докато нуклеозидът няма фосфатна група.
Нуклеозидите и нуклеотидите са подобен тип молекули, които се различават чрез лека структурна промяна. И нуклеотидът, и нуклеозидът са съставени от същите два компонента; пентозна захар и азотна основа. Освен това нуклеотидът има една или повече фосфатни групи. Следователно, чрез добавяне на фосфатна група, нуклеозид може да се превърне в нуклеотид от ензимите, наречени киназа. Нуклеотидът е градивният елемент на нуклеиновите киселини. От друга страна, нуклеозидите са добри противоракови и антивирусни вещества.