Ключовата разлика между лизозомите и рибозомите е, че лизозомите са клетъчните места за разграждане на боклука, докато рибозомите са клетъчните места на синтезиращите протеини.
Клетката има различни компоненти и тези компоненти играят различни роли в клетката, които спомагат за оцеляването на живите организми. Сред различните клетъчни компоненти лизозомите и рибозомите са два важни клетъчни компонента. Тези две структури изпълняват две различни функции в клетката. Следователно и двете са жизненоважни за функционирането на клетките. Лизозомите съдържат различни храносмилателни ензими, които помагат за разграждането на нежеланите неща, натрупани вътре в клетката. От друга страна, рибозомите са от съществено значение за протеиновия синтез. Въпреки че те са основни клетъчни компоненти, лизозомите присъстват само в еукариотните клетки, докато рибозомите присъстват както в еукариотните, така и в прокариотните клетки.