Ключовата разлика между пъпната кръв и стволовите клетки от костния мозък е, че стволовите клетки от пъпната кръв са хематопоетичните клетки, които се намират в пъпната връв на новороденото след раждането, докато стволовите клетки от костния мозък са стволовите клетки, присъстващи в костния мозък тъкан на индивиди.
Трансплантацията на стволови клетки е често срещана терапевтична процедура, при която пациентът получава доза кръвотворни (стволови) клетки, за да замести собствените си разрушени клетки от болест или от други терапевтични процедури. Както стволовите клетки от пъпна кръв, така и стволовите клетки от костния мозък имат терапевтични цели (трансплантации). Следователно, обичайната употреба на тези стволови клетки е да се заменят нездравите клетки със здрави. Клинично най-често срещаните източници на здрави клетки са клетките на пъпната връв и клетките на костния мозък.
