Основната разлика между фукоидан и фукоксантин е, че фукоиданът е съдържащ фукоза сулфатиран полизахарид, присъстващ в различни видове кафяви водорасли и кафяви водорасли, докато фукоксантинът е ксантофил, присъстващ като допълнителен пигмент в хлоропластите на кафявите водорасли и други хетероконти.
Морските екосистеми съставляват както флора, така и фауна. Те имат голямо разнообразие от видове. Освен това тези видове съдържат различни съединения, които са полезни за хората. Биомолекулите, извлечени от тези видове в морските екосистеми, съдържат различни терапевтични възможности. Фукоидан и фукоксантин са две такива съединения, присъстващи в морските екосистеми, главно в кафявите водорасли. Въпреки че се различават химически, двете съединения в момента се използват за различни изследователски цели за идентифициране на техния потенциал като терапевтични средства.
