Ключовата разлика между йонотропните и метаботропните рецептори е, че йонотропните рецептори позволяват свързването на йонни лиганди към тях, което отваря йонния канал. Междувременно метаботропните рецептори позволяват свързването на химични лиганди с рецепторите, инициирайки каскада от реакции чрез свързване с G протеин.
Предаването на сигнали и мембранният транспорт са важни процеси в биологията. И двете играят жизненоважна роля в регулирането на метаболизма в системата. По-голямата част от метаболитните пътища и мембранния транспорт се осъществяват чрез рецептори, които се свързват с лиганди, които могат да бъдат или йонни лиганди, или химични лиганди.