Ключовата разлика между хомонуклеарните и хетероядрените ароматни съединения е, че хомонуклеарните ароматни съединения съдържат атоми на едни и същи химични елементи в пръстенната структура, докато хетероядрените ароматни съединения съдържат атоми на различни химични елементи в пръстеновидната структура.
Хомонуклеарните и хетероядрените ароматни съединения са органични съединения, съдържащи пръстенни структури. И тези пръстеновидни структури съдържат или еднакви атоми, или различни атоми. Следователно те имат различни химични и физични свойства в зависимост от вида на атомите в пръстеновидните структури.