Ключова разлика - Протеомика срещу транскриптомика
Омическата технология е актуална тенденция, при която различните биомолекули на даден организъм се разглеждат като цялостна колекция по отношение на неговите свойства и функции. Технологията omic има широк спектър от приложения. Различните омици на биологична проба включват геномика, протеомика, транскриптомика и метаболомика. Протеомиката включва цялостно изследване на всички протеини в живия организъм. Определя се като съвкупността от всички експресирани протеини в организма, неговите структурни и функционални свойства. Следователно пълният набор от протеини образуват протеома. Транскриптомиката е цялостно изследване на всички молекули на пратеника РНК (иРНК), присъстващи в живия организъм. По този начин транскриптомиката се занимава с гените, които се експресират активно в живия организъм. Общият набор от иРНК в жив организъм се нарича транскриптом. Ключовата разлика между протеомиката и транскриптомиката се основава на вида на биомолекулата. В протеомиката се изследва общият набор от експресирани протеини в живия организъм, докато в транскриптомиката се изследва общата мРНК на живия организъм.
СЪДЪРЖАНИЕ
1. Общ преглед и ключова разлика
2. Какво е протеомика
3. Какво е транскриптомия
4. Прилики между протеомика и транскриптомика
5. Сравнение едно до друго - Протеомика срещу транскриптомика в таблична форма
6. Резюме
Какво е протеомика?
Терминът протеомика е въведен през 1995 г. и първоначално е дефиниран като общия протеинов комплемент в клетка, тъкан или организъм. С напредъка в протеомичните изследвания той беше модифициран, за да се разглежда като общ термин, в който бяха включени много области на изследване. В момента под темата протеомика се изучават структурата, ориентацията, функциите, нейните взаимодействия, нейните модификации, нейните приложения и значението на протеините. Поради това в момента се провеждат много изследвания в областта на протеомиката.
Първите протеомични проучвания са направени за идентифициране на съдържанието на протеин в Escherichia coli. Картографирането на общото съдържание на протеин е направено с помощта на двуизмерни (2D) гелове. След успеха на това учените преминаха към характеризиране на общото съдържание на протеини в животни като морски свинчета и мишки. Понастоящем картографирането на човешки протеин се извършва с помощта на 2D гел електрофореза.
Приложения на протеомиката
Има много предимства от изучаването на протеомиката, тъй като протеините са управляващите молекули на по-голямата част от активността поради каталитичното свойство на протеините. По този начин, изследването на цели протеини може да предостави информация относно здравословното състояние на организма. Някои приложения са;
- Анотация на генома: Чрез изучаване на съдържанието на протеини в организма могат да се определят точните геноми, отговорни за активното протеиново съединение. В този сценарий са важни резултатите от цялата геномика, транскриптомиката и протеомиката.
- Идентифициране / диагностика на заболяването: Протеомиката се използва при идентифициране на болестното състояние, като се сравняват здравите и болните
- За извършване на протеинова експресия, изследвана по време на експерименти
- Модификации на протеини и проучвания на взаимодействията: За да се използват протеини in vitro или in vivo условия, да се определят условията за съхранение на тези извлечени протеини и да се изследва поведението на протеините in vitro, in vivo и in silico методи.
Фигура 01: Протеомика
В протеомиката участват различни техники
- Екстракция на общия протеин и разделяне на протеините с помощта на 2D гел електрофореза. Протеините също могат да бъдат разделени с помощта на високоефективна течна хроматография (HPLC).
- Секвениране на екстрахираните протеини с помощта на методи като метод на секвениране на Едмънд или масспектрометрия.
- След като се идентифицират последователностите, структурните и функционални свойства на съдържанието на протеин се анализират с помощта на компютърен софтуер и инструменти за биоинформатика.
Какво е транскриптомика?
Терминът за транскриптом е създаден наскоро. Транскриптомиката е изследване на общото съдържание на иРНК в организма. Общата мРНК е експресираната ДНК в жив организъм или клетка. Пълната колекция от иРНК се нарича транскриптом.
Стъпките към анализ на транскриптома включват,
- Екстракция на РНК, разделяне на иРНК с помощта на колонна гел хроматография с поли DT мъниста.
- Последователността на иРНК се прави.
Технологията на микрочиповете е един често срещан начин за идентифициране на транскриптома на организма. Техниката на микрочиповете включва плоча със сонда с допълнителните нишки на транскриптома. При хибридизация може да се характеризира иРНК, присъстваща в организма или клетките.
Фигура 02: Транскриптомични техники
Понастоящем транскриптомиката се използва широко в медицинската област. Диагностиката на заболяванията и профилирането на заболявания са основните области, в които се използва транскриптомиката. Чрез анализ на транскриптом на даден организъм може да се идентифицира чужда мРНК и ако има някакви инфекции, тя може да бъде идентифицирана. Некодиращата РНК може да бъде разделена с помощта на транскриптомни технологии. А също така може да се наблюдава експресията на гени при различни екологични стресове.
Какви са приликите между протеомиката и транскриптомиката?
- И двете формират част от концепцията за omic технология.
- И двете се използват при диагностика на заболяването и характеризиране на заболяването на организма.
- И двете области на изследване включват екстракция на биомолекулата, разделяне на биомолекулата и стъпки на секвениране.
Каква е разликата между протеомиката и транскриптомиката?
Различна статия Средна преди таблица
Protemics срещу Transcriptomics |
|
| Протеомиката включва цялостно изследване на всички протеини в живия организъм. | Транскриптомиката е цялостно изследване на всички молекули на пратеника РНК (тРНК), присъстващи в живия организъм. |
| Изследван тип био молекула | |
| Протеините се изучават в протеомиката. | иРНК се изучават в транскриптомиката. |
| Изучени фактори | |
| Структура, функция, взаимодействия, модификации и приложения на протеините се изучават в протеомиката. | Структурата на последователността, взаимодействията с околната среда и приложенията на иРНК се изучават в транскриптомиката. |
Резюме - Протеомика срещу транскриптомика
Omics играят важна роля в областта на науките за живота. Протеомиката се отнася до изследването на протеома, който формира пълните колекции от протеини в клетка или организъм. Транскриптомиката се отнася до изследването на транскриптома, който е пълният набор от експресирана ДНК, която е под формата на иРНК. Двете области на изследване, протеомиката и транскриптомиката, са получени след въвеждането на геномиката и в момента се използват широко в медицинската диагностика и при характеризирането и скрининга на организмите. Това е разликата между протеомиката и транскриптомиката.
Изтеглете PDF на Proteomics срещу Transcriptomics
Можете да изтеглите PDF версията на тази статия и да я използвате за офлайн цели според бележката към цитата. Моля, изтеглете PDF версията тук: Разлика между протеомиката и транскриптомиката
