Ключовата разлика между CRP и хомоцистеина е, че С реактивният протеин (CRP) е пентамерен протеин, докато хомоцистеинът е непротеиногенна алфа аминокиселина.
Възпалението е сложен биологичен отговор, разработен срещу различни вредни стимули като патогени, увредени клетки в тялото или дразнители. Той включва имунни клетки, молекулярни медиатори и кръвоносни съдове. Освен това, различни маркери показват възможни възпалителни състояния. Следователно, тези маркери се използват на клинични нива за идентифициране на различни болестни състояния, свързани с възпалението. С реактивният протеин (CRP) и хомоцистеинът са два такива маркера.