Основната разлика между фотобионта и микобионта е, че фотобионтът се отнася до фотосинтетичния компонент на лишея, който е зелена водорасли или цианобактерия, докато микобионтът се отнася до гъбичния компонент на лишеите, който е предимно аскомицет или базидиомицет.
Съществуват различни видове симбиотични взаимоотношения между живите организми. Симбиотичната връзка е асоциация, в която два различни вида организми живеят заедно. Освен това паразитизмът, мутуализмът и коменсализмът са три вида симбиотични отношения. Взаимността е полезна и за двете страни. Лишейът е такъв вид мутуалистична асоциация, която съществува между водорасли / цианобактерии и гъбички. В тази асоциация едната страна отговаря за производството на храна чрез фотосинтеза, докато другата страна е отговорна за усвояването на водата и осигуряването на подслон. Въз основа на това водораслите / цианобактериите са известни като фотобионта, който извършва фотосинтеза, докато гъбата е известна като микобионта, който осигурява подслон и абсорбира вода.
