Ключовата разлика между синтетона и синтетичния еквивалент е, че синтенът е част от химично съединение, което може да се образува чрез известен синтетичен процес, докато синтетичният еквивалент е реагент, който изпълнява функцията на синтетон.
Термините синтен и синтетичен еквивалент попадат в клона на ретросинтетичния анализ. Това е техника, която е полезна за решаване на проблемите, които възникват по време на планирането на процеса на органичен синтез. В тази техника на анализ трябва да трансформираме целевата молекула в проста структура без ефекта от взаимодействието на реагента. Понякога използваме взаимозаменяемите термини синтен и синтетичен еквивалент, но те са два различни компонента.