Ключовата разлика между автогенното и реципрочното инхибиране е, че автогенното инхибиране е способността на мускула да се отпусне, когато изпитва разтягане или повишено напрежение, докато реципрочното инхибиране е отпускането на мускулите от едната страна на ставата, за да се приспособи контракцията от другата страна на тази става.
Мускулите се разтягат и отпускат. За да се поддържат мускулните контракции, в мускулните клетки присъстват механични рецептори, които изпращат информация до централната ни нервна система. Мускулното вретено и сухожилият орган на Голджи (GTO) са два сетивни органа на стреч рефлекса. Мускулите се свиват в отговор на разтягане на мускулите. GTO инхибира мускулната активация, за да намали напрежението на мускулите и сухожилията.
Автогенното и реципрочното инхибиране са два вида рефлексни релаксации, които предпазват мускулите от повреди и наранявания. Релаксацията на автогенното инхибиране е способността на мускула да се отпусне, докато изпитва повишено напрежение. Извършва се от GTO. За разлика от това, реципрочното инхибиране е релаксация на противоположния мускул, когато агонистичният мускул изпитва разтягане.