Ключовата разлика между динеин и кинезин е, че динеинът е двигателен протеин на цитоскелета, който се движи към минусовия край на микротубулите, докато кинезинът е друг двигателен протеин на цитоскелета, който се движи към плюс края на микротубулите.
Цитоскелетът се състои от различни видове нишки. Микротубулите са един вид сред тях. Те насочват движението на материала в клетката. Те са важни и за поддържане формата на клетката. Освен това микротубулите са жизненоважни за разделянето на хромозомите при митоза и мейоза. Освен това, микротубулите са ключови компоненти на ресничките и биччетата на някои еукариотни клетки. Структурно микротубулите са полярни структури. Те имат плюс и минус. По принцип минусовият край се простира към центъра на клетката, докато плюсът се простира към клетъчната повърхност. По време на вътреклетъчния транспорт на везикули и органели два вида цитоскелетни двигателни протеини помагат на микротубулите. Те са динеини и кинезини. Динеините се движат към минусовия край на микротубулите, докато носят материали до центъра на клетката. За разлика от тях, кинезините пътуват към клетъчната повърхност, пренасяйки материали до периферията на клетката.