Основната разлика между убихиноните и цитохромите е, че убихиноните (CoQ) не са протеини, докато цитохромите са протеини.
Електронната транспортна верига е последният етап от аеробното дишане. Следователно се среща във вътрешната мембрана на митохондриите. Нещо повече, той се състои от електронни носители, които улесняват производството на протонен градиент през мембраната. Освен NAD и флавопротеините, убихиноните и цитохромите са два вида електронни носители, участващи в електронната транспортна верига. Убихиноните са непротеинови разтворими в липиди, хидрофобни органични молекули, докато цитохромите са железосъдържащи протеини.
