Ключовата разлика между максималната съобразеност и максималната вероятност зависи от метода, използван при разработването на филогенетичното дърво. Максималната съобразителност се фокусира върху минимизиране на общите състояния на характера по време на изграждането на филогенетичното дърво, докато максималната вероятност е статистически подход при изчертаването на филогенетичното дърво в зависимост от вероятността между генетичните данни.
Филогенията е новият подход към класификацията и номенклатурата на организмите. Филогенията разчита на генетични данни и еволюционни взаимоотношения. Генетичните данни са резултат от секвениране на ДНК. Във филогенията класификацията на организмите се извършва въз основа на общия прародител. Максималната съобразителност и максималната вероятност за филогенетична връзка увеличават точността и надеждността на филогенетичното дърво.
