Ключовата разлика между Klenow фрагмент и ДНК полимераза 1 е, че Klenow фрагментът е голяма част от ДНК полимераза 1, на която липсва 5 'до 3' екзонуклеазна активност, докато DNA полимераза е ензим на E. coli, който има и трите домена, включително 5 'до 3 ′ екзонуклеазна активност.
ДНК полимеразата е един от ключовите ензими, участващи в репликацията на ДНК в живите организми. Съществуват различни форми на ДНК полимеразен ензим, открити в еукариотите и прокариотите въз основа на размера и формата. ДНК полимераза 1, 2 и 3 се срещат само в прокариотните организми и те играят различни роли в репликацията на ДНК. ДНК полимераза 1 има три домена с 5 'до 3' полимераза, 3 'до 5' екзонуклеазна активност и 5 'до 3' екзонуклеазна активност. Klenow фрагмент е протеолитичен продукт на ДНК полимераза 1. Той притежава 5 до 3 'полимераза и 3' до 5 'екзонуклеазна активност на интактна ДНК полимераза 1, но липсва 5' до 3 'екзонуклеазна активност.