Ключовата разлика между екзенцефалията и аненцефалията е, че екзенцефалията е главно нарушение, при което мозъчните тъкани са разположени извън черепа поради липсата на черепна кухина и скалп. Междувременно аненцефалията е цефално разстройство, което се характеризира с липсата на голяма част от мозъка, черепа и скалпа поради неуспеха на ростралната невропора да се затвори.
Вродените нарушения възникват поради невронни дефекти, които се случват по време на бременност. Те водят до висока степен на смъртност, което прави състоянието фатално. Еценцефалията и аненцефалията са две такива вродени разстройства, както и цефалични разстройства, наблюдавани при кърмачета. При екзенцефалията мозъкът е разположен извън черепа. При аненцефалията отсъства голяма част от мозъка, черепа и скалпа. Еценцефалията се счита за ембриологичен предшественик на аненцефалията. Екзенцефалията обаче е изключително рядко състояние в сравнение с аненцефалията.
