Ключовата разлика между фагоцитозата и опсонизацията е, че фагоцитозата е механизъм, изпълняван от определени клетки или организми за поглъщане или поглъщане на чужди частици, докато опсонизацията е процес, при който патогените се отстраняват от системата след маркирането им с помощта на опсонини.
Имунологичните отговори могат да бъдат вродени или адаптивни. Патогените притежават рецептори за разпознаване на патогени, които улесняват идентифицирането от гостоприемника. Опсонизацията и фагоцитозата са два имунологични отговора. При опсонизацията гостоприемникът идентифицира и маркира нахлуващи частици за унищожаване чрез производството на опсонини. Фагоцитозата е механизъм, чрез който определени имунни клетки поглъщат и унищожават нахлуващи частици или чужди частици от тялото.
