Основната разлика между Е. coli и Pseudomonas aeruginosa е, че Е. coli е факултативен анаеробен бактериален вид, който принадлежи към семейство Enterobacteriaceae и род Escherichia, докато P. aeruginosa е аеробен бактериален вид, който принадлежи към семейство Pseudomonadadaceae и род Pseudomonas.
Е. coli и Pseudomonas aeruginosa са грам-отрицателни, пръчковидни и подвижни бактерии. Освен това те са капсулирани бактерии. Но Е. coli е вид от род Escherichia, докато P. aeruginosa е вид от род Pseudomonas.
