Ключовата разлика между алозимите и изозимите е, че алозимите се кодират от различни алели в един и същ локус. Но за разлика от тях изозимите се кодират от гени в различни локуси.
Ензимите са биокатализатори, които ускоряват биохимичните реакции. Всъщност те са протеинови молекули, кодирани от гени. Има различни видове ензими. Някои ензими са кодирани от различни алели на един и същ ген, присъстващи в един и същ локус. Те са известни като алозими. За разлика от тях, някои ензими са кодирани от различни гени, разположени в различни локуси. Тези ензими са известни като изоензими. Изозимите и алозимите могат да се използват за определяне на връзката между два организма.