Ключовата разлика между AMPA и NMDA рецепторите е, че специфичният агонист на AMPA рецептора е алфа-амино - 3 - хидроксил - 5 - метил - 4 - изоксазол пропионова киселина (AMPA), докато специфичният агонист на NMDA рецептора е N - метил - D - аспартат (NMDA).
Има три основни типа глутаматни рецептори. Тяхната разлика се основава на агониста, който се свързва за активиране на рецептора за свързване на глутамат. Свързването с глутамат ще отвори йонно затворените канали за транспортиране на натриеви и калиеви йони. Също така, NMDA рецепторите също улесняват потока на калциеви йони през мембраната.
